医院普通外科是国家级重点学科，是集医疗、教学、科研为一体的创新型体系，医院前列。经过多年的发展，医院普通外科英才名医荟萃、师资力量雄厚、医疗技术精湛、诊疗设备先进、科研实力强大，拥有肝脏外科（包括血管外科）、胆胰外科、胃肠外科及甲乳外科等多个亚专科，开放床位共张，手术60余台/天，人才梯队完备，汇集了多名国内外享有盛誉的知名专家，高级职称临床专业技术人员47人，其中中国科学院院士1人，国家杰出青年基金获得者1人，二、三级教授12人。逾20名专家在国家一级学会任职全国委员及以上职务，作为第一完成人单位获得国家奖二等奖1项、何梁何利科技进步奖1项。
“同舟共济，服务社会”是历代同济人的信念。早在抗美援朝期间，医院外科即组织医疗队救治了大批 伤病员。年，裘法祖教授、夏穗生教授等率先在国内开展了规则性肝切除术治疗肝癌。年发表我国第一篇肝切除治疗肝癌的论文，详述肝门血管胆道分布规律，为创建规则性切除术式提供了解剖学基础。同年，在我国首次施行狗异位肝移植，突破了移植禁区。20世纪70年代初系统开展狗经典原位肝移植次，探索出整套供临床应用的术式，医院同时在年开展以肝癌病人为主的临床肝移植。这些成就奠定了普通外科专业在国内的一流地位。改革开放以来，医院针对影响人民群众健康的重要疾病进行研究，并强调医疗创新成果的临床应用，取得了一系列令人瞩目的成绩：世界首例活体脾移植；亚太地区首例胰肾联合移植；国内首例腹部多器官联合移植；腔镜及机器人技术在肿瘤治疗方面的创造性运用等，为更多病人带来了福音。
肝脏外科目前是全球最大的肝癌诊疗中心之一，综合实力名列世界前茅，在大肝癌和门静脉高压症的外科治疗方面均取得了一系列的开创性成果。
大肝癌的外科治疗：提出新的肝癌分类；提出大肝癌可安全切除的理论；建立控制肝切除出血技术3项。这些理论和技术均成功地转化到临床治疗病人，效果显著，相关成果获国家科技进步二等奖。随着微创外科技术的进步，肝脏外科形成了开放、腔镜及机器人三位一体的肝癌手术切除模式，腹腔镜和机器人肝切除数量和难度亦处于世界领先水平，并在此基础上牵头成立了亚太地区腹腔镜肝切除发展与推广委员会和中国腹腔镜肝切除发展与推广委员会。同时，对于部分合适病人，肿瘤消融和肝移植工作的开展亦完善了肝癌的外科综合治疗模式。正是基于这些大量临床实践经验，学科带头人陈孝平院士牵头制定了中华医学会“原发性肝癌外科治疗方法的选择”和“肝细胞癌诊断与治疗路线图和我国“肝癌微创治疗质量安全工作规程”，使医院肝癌外科治疗处于国内领先、国际先进的地位，相关项目获得湖北省科技推广奖一等奖及中国抗癌协会科技奖一等奖等。
门静脉高压症的外科治疗一直是同济普外的一个特色。裘法祖院士倡导的贲门周围血管离断术为我国晚期肝硬化病人，尤其是晚期血吸虫病肝硬化病人治疗做出了巨大的贡献。近年来，由于肝硬化病人疾病谱的变化和腔镜技术的开展，肝脏外科逐渐形成了包括断流、分流及内镜治疗等多模式、个体化的门静脉高压症外科治疗体系。腹腔镜下贲门周围血管离断术的常规开展，部分病人断流与分流结合的个性化治疗都成为新的同济特色。
此外，活体辅助性肝移植的实验和临床研究亦是同济肝脏外科的一大特色。目前这一术式已经被证实对于代谢性疾病、自身免疫性肝病和晚期血吸虫病疗效显著。早在上世纪80年代，陈孝平院士即在世界上首次提出辅助性部分肝移植治疗终末期肝病的设想并率先建立辅助性部分肝移植动物模型，缓解供肝不足的矛盾。这一研究成果获得卫生部科技成果甲等奖。之后的临床成功转化，使大量病人从中受益。年，轰动全球的“暴走妈妈”割肝救子的故事即是这一理念应用于临床的最好佐证。手术获得巨大成功，术后已9年多，母子均健在。这一理念和术式进一步完善了肝脏外科疾病的治疗模式。
目前，肝脏外科在研的临床研究10余项，其中全国多中心试验共5项，近5年承担国家级课题20余项，以陈孝平院士、张必翔教授、张志伟教授、黄志勇教授、陈义发教授为首的研究团队已在GUT、Gastroenterology、Hepatology等多种有影响力的杂志发表多篇高水平论文，广受同行的好评。
胆胰外科医疗团队具有丰富的工作经验，对疑难胆道和胰腺疾病的诊治有较高的造诣，其中胰腺肿瘤和胆道肿瘤的根治性手术切除和手术后综合治疗及对胰腺内分泌肿瘤的手术治疗均已达到国内领先水平。曾率先在国内开展了急性胰腺炎病人的肠外和肠内营养支持治疗，使重症胰腺炎的疗效有明显的改观。临床研究方向主要集中在胆道、胰腺疾病的发病机理和诊断及治疗方面，尤其是胰腺肿瘤、胆道肿瘤的早期诊断和基因治疗。年，胆道肿瘤的生物学特性研究获得教育部科技进步二等奖。年，阻塞性黄疸对机体损害的基础与临床研究获得武汉市科技进步一等奖。年，胰腺肿瘤的基础及临床研究获得武汉市科技进步一等奖。年，胆胰肿瘤外科治疗的技术创新及临床应用获得湖北省科技进步奖一等奖，胆胰肿瘤外科治疗体系及靶向治疗的创新获得华夏医学科技奖二等奖。目前每年可完成胰十二指肠切除术近台，其中腹腔镜胰十二指肠切除术余台，组织编写了国内第一版腹腔镜下胰十二指肠切除术专家共识，同时开展了腹腔镜下胆囊癌、肝门部胆管癌根治切除术。
甲乳外科成立于年，在甲状腺肿瘤、乳腺肿瘤外科治疗领域具有丰富的临床经验。科室设有三个病区，每年开展各类甲状腺、乳腺手术余台。在乳腺肿瘤综合诊治领域，积极开展电子乳腺纤维内窥镜检术、乳腺疾病可视化电子成像技术、前哨淋巴结活检术、空心针活检术等微创检查治疗项目，提高乳腺癌的术前TNM分期准确率和诊断正确率，在乳腺疾病的早期诊断和微创治疗方面处于国内领先地位；同时积极推进乳腺恶性肿瘤的规范化、个体化治疗：建立了一整套乳腺癌综合治疗模式，包括手术、化疗（含新辅助化疗）、内分泌治疗和靶向治疗，显著提高乳腺癌患者预后；科室常规开展乳腺癌保乳手术和乳腺癌术后一期重建手术，为乳腺癌患者术后提供良好的生活质量；积极建立乳腺恶性肿瘤样本库和乳腺恶性肿瘤术后随访系统。在甲状腺肿瘤诊治领域，开展的甲状腺肿块细针穿刺，术中喉返神经检测，术中甲状旁腺快速识别检测与保护，复杂甲状腺癌手术切除与器官重建等多项新技术业务，取得显著疗效。科室团队还承担了众多的国家自然科学基金，国家重点研发计划，省部级科研项目和药品医疗器械临床试验等研究工作，具有较强的临床和科研能力，居国内领先水平。
胃肠外科拥有4个病区近张床位，年均完成8万余人次的门诊量、余人次的住院患者诊治以及余台手术，主要致力于胃肠道疾病特别是胃肠道肿瘤的治疗和研究，作为医院建立“疑难危重疾病救治基地”和“大型手术基地”的重要组成部分，胃肠道恶性肿瘤（如胃癌，结肠癌，直肠癌等）的诊治，在中南地区乃至全国处于领先地位。胃肠外科的领先医疗，源于持续的创新，近十几年来先后承担了包括“国家杰出青年科学基金”、“项目”、“国家自然科学基金重点项目”、“卫生部临床重点项目”等多项国家级重点研究项目，这些研究的结果催生并率先实现了腹腔镜胃肠道肿瘤手术的规模化，提出基于腹腔镜胃肠道手术的全系膜切除理念以及“肿瘤第5转移途径”概念。
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